Географическая структура транспортной сети России предельно проста. Существует Главный транспортный коридор, пересекающий страну с северо-запада (от Санкт-Петербурга) юго-восток (до Владивостока, через Москву, Нижний Новгород, Екатеринбург, Новосибирск, Красноярск).

К этому широтному коридору присоединены меридиональные транспортные оси севе юг и юг- север, большинство из которых представлены крупными реками либо транспортными коридорами вдоль долин крут рек. Пересечение Главного коридора с транспортными осями приводит к формированию крупных транспортных узлов. Поток «древовидной» транспортной сети осуществляется подавляет большинство внутрироссийских перемещений. Выход во внешний мир осуществляется через морские порты (Архангельск, Мурманск, Санкт-Петербург, Таганрог, Новороссийск, Астрахань, Владивосток), количество которых и пропускная способность явно недостаточны для обеспечения внешних связей, а также сухопутные транспортные системы сопредельных государств (Беларуси, Украины, Казахстана).

Поэтому рост внешнеэкономических связей будет физически возможен только при дальнейшем развитии транспортной сети и поддержании эффективного сотрудничества с сопредельными государствами.

В процессе производства и потребления продукции между различными отраслями народного хозяйства и экономическими районами складываются транспортно-экономические связи, определяющие объем, направление и структуру грузопотоков. В свою очередь, направление и мощность транспортно-экономических связей зависят от особенностей географического положения отдельных районов, себестоимости производства и перевозок.

Каждый продукт имеет свой район производства и зону сбыта. Из нескольких сотен наименований перевозимых грузов выделяются 8 групп грузов, которые в перевозках железнодорожного и водного транспорта занимают свыше 80%. Эти виды грузов относятся к массовым, их перевозки определяют грузооборот. Размеры транспортных потоков массовых грузов (каменного угля, нефти и нефтепродуктов, лесных и хлебных грузов) зависят от размещения основных баз производства, основных районов потребления, а также внешнеторговых потребностей.

В транспортной системе России железные дороги занимают ведущее положение, тогда как в большинстве других государств удельный вес железнодорожных перевозок ниже. Соизмеримы с российскими показателями по доле железных дорог в грузообороте всех видов транспорта, лишь Канада (73%) и США (50%), по доле в пассажирообороте Япония (31%). Уровень конкуренции между различными видами транспорта в России, намного ниже, чем в остальных странах мира. Это очень важный фактор, который необходимо учитывать при выборе модели организации железнодорожной отрасли.

Размещается железнодорожный транспорт неравномерно. Густой и разветвленной железнодорожной сетью обладает европейская часть страны. Конфигурация сети - радиально-кольцевая с центром в Москве. От Московского железнодорожного узла отходят основные магистрали в направлении Донбасса, Одессы, Чопа, Казани, Самары, Саратова, Волгограда, Минска, Риги, Санкт-Петербурга, Архангельска и др. В восточной части страны железнодорожная сеть имеет ярко выраженное широтное направление малой разветвленностью. Важнейшей магистралью, связываюшей Центр с Уралом, Сибирью и Дальним Востоком, является Трансконтинентальная железная дорога: Москва — Рязань— Рузаевка — Сызрань - Самара - Уфа - Челябинск – Иркутска — Хабаровск — Владивосток длиной 9332 км. Построена Байкало-Амурская магистраль, Усть-Кут - Комсомольск-на-Амуре. Важное значение для России имеют Южно-Сибирская и Среднесибирская железнодорожные магистрали, проходящие через территорию Казахстана. В меридиональном направлении действует Тюмень — Сургут — Уренгой.